Neuvottelukunnan tehtävä on toimia edunvalvojana valtakunnan tasolla sekä alueen ja yliopistojen välisenä tiedotus- ja vuorovaikutuskanavana. Neuvottelukunta edistää alueella tehtävää tutkimus- ja koulutustyötä seuraamalla tutkimuksen, koulutuksen ja innovaatiotoiminnan tilaa ja tarvetta suhteessa toimintaympäristön muutoksiin. Se edistää yliopistokeskuksen tehtävien toteuttamisen yleisiä edellytyksiä ja tekee alueen yliopistotoimintojen kehittämistä koskevia aloitteita ja esityksiä. Neuvottelukunnan toimikausi on 2009-2011. Neuvottelukunnan jäsenet:

• Maakuntajohtaja Matti Viialainen, Etelä-Savon maakuntaliitto, pj.
• Päätoimittaja Tapio Honkamaa, Länsi-Savo Oy
• Asiakaspäällikkö Harri Huhta, MTT-Mikkeli
• Toimitusjohtaja Heikki Hämäläinen, Osuuskauppa Suur-Savo
• Kansanedustaja Katri Komi
• Toimitusjohtaja Markku Kakriainen, Etelä-Savon kauppakamari
• Kehitysjohtaja Soile Kuitunen, Mikkelin kaupunki
• Vararehtori Kimmo Kontula, Helsingin yliopisto
• Rehtori Heikki Saastamoinen, Mikkelin ammattikorkeakoulu
• Osastopäällikkö Juha Pulliainen, Etelä-Savon TE-keskus
• Toimitusjohtaja Miika Puukko, Platom Oy
• Yrittäjä Pepita Pylkkänen, Tertin kartano
• Toimitusjohtaja Vesa Sorasahi, Miktech Oy
• Kansanedustaja Lenita Toivakka
• Kansanedustaja Pauliina Viitamies
• Pääsihteeri Matti Malinen, Mikkelin yliopistokeskus, siht.